Em 1837, padre Luís Scrosoppi fundou a Congregação das Irmãs da Providência, em Údine, na Itália. Sua missão era dar assistência aos mais pobres, especialmente às meninas órfãs e abandonadas, aos doentes e anciãos.

No Brasil, em 1927, foi fundada a primeira casa na cidade de Tietê – SP. Mais tarde, as Irmãs transferiram-se para Sorocaba, e em 1955 se instalaram em Atibaia com o noviciado, que deu origem à “Escola Particular São José” – onde contavam com apenas duas salas de Jardim de Infância.

Em 1956, as Irmãs obtiveram autorização para o funcionamento de ensino para o 1º grau, ano em que, foi lançada, junto ao noviciado, a pedra fundamental para a construção definitiva do prédio que deu origem ao Externato São José.

Em 1979, sob a direção da Irmã Araceli, o colégio obteve autorização para o funcionamento do 2º grau.

Em 1982, as irmãs iniciaram as negociações para a transferência da administração do Colégio ao padre Armando Tamassia sacerdote diocesano, tendo como diretor escolar o professor Luiz Alberto Favret.

Em 1994, com o falecimento do padre Armando Tamassia a ordem dos Franciscanos assumiu a gestão do colégio que continuou pertencendo às Irmãs da Providência.

Em 2005, as Irmãs da Providência reassumiram a gestão administrativa e pedagógica do Externato São José, sob a direção geral da Irmã Maria Benedita de Oliveira, direção administrativa de Mauricio Alberto de Freitas e direção pedagógica de Rosaura Domingues dos Reis.

No início do ano de 2014, assumiram a Direção Geral – Irmã Marinalda Aparecida Michelassi e Direção Pedagógica – Prof. M.s. José Antonio Lima.

De 2016 a 2019, o Externato São José teve como gestores o seguinte quadro: Diretora Geral Loredana Busatto.

Atualmente, o colégio tem como Diretora Geral a Ir. Rosana Assis e a Diretora Pedagógica Prof. Mariclei Marcelino Bortolotto.